Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn34b4Q3V0X2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn34b4Q3V0X2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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