Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.27■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930567H17RikQ3V0K5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms