Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5aQ3UXZ9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm5aQ3UXZ9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms