Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc114Q3UX62 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms