Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E330034G19RikQ3UWX6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms