Protein–RNA interactions for Protein: Q3UST5

UPF0764 protein C16orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UST5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UST5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UST5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3UST5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3UST5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3UST5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3UST5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3UST5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3UST5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UST5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UST5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UST5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UST5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3UST5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms