Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syndig1lQ3USQ7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms