Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Znf48Q3US17 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Znf48Q3US17 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Znf48Q3US17 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Znf48Q3US17 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Znf48Q3US17 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Znf48Q3US17 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Znf48Q3US17 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Znf48Q3US17 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Znf48Q3US17 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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