Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TceancQ3US16 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TceancQ3US16 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms