Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms