Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SbsponQ3UPR9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsponQ3UPR9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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