Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UPC7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UPC7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UPC7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3UPC7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3UPC7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms