Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tmem253Q3UNB8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tmem253Q3UNB8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Tmem253Q3UNB8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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