Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms