Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cobll1Q3UMF0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cobll1Q3UMF0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms