Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc33Q3ULW6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc33Q3ULW6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms