Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms