Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtrcQ3ULA2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtrcQ3ULA2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms