Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms