Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp19Q3UJD6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp19Q3UJD6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Usp19Q3UJD6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Usp19Q3UJD6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Usp19Q3UJD6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Usp19Q3UJD6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Usp19Q3UJD6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Usp19Q3UJD6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Usp19Q3UJD6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Usp19Q3UJD6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp19Q3UJD6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp19Q3UJD6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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