Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms