Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitpnm3Q3UHE1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pitpnm3Q3UHE1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms