Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx27Q3UHD6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx27Q3UHD6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms