Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp8Q3UD82 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp8Q3UD82 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms