Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pid1Q3UBG2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pid1Q3UBG2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms