Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trip13Q3UA06 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trip13Q3UA06 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms