Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf180Q3U827 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf180Q3U827 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf180Q3U827 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf180Q3U827 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf180Q3U827 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf180Q3U827 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf180Q3U827 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Rnf180Q3U827 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf180Q3U827 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Rnf180Q3U827 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf180Q3U827 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf180Q3U827 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf180Q3U827 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Rnf180Q3U827 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Rnf180Q3U827 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf180Q3U827 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf180Q3U827 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Rnf180Q3U827 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf180Q3U827 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf180Q3U827 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf180Q3U827 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf180Q3U827 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnf180Q3U827 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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