Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hectd3Q3U487 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hectd3Q3U487 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms