Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
InipQ3TXT3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms