Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Srsf6Q3TWW8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf6Q3TWW8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms