Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CiartQ3TQ03 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CiartQ3TQ03 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms