Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms