Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Uri1Q3TLD5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uri1Q3TLD5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms