Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3KNL4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3KNL4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3KNL4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3KNL4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3KNL4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3KNL4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms