Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M3Q31093 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms