Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms