Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim71Q1PSW8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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