Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrriq3Q14DL3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms