Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam171bQ14CH0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam171bQ14CH0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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