Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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ptchd1Q14B62 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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ptchd1Q14B62 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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ptchd1Q14B62 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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ptchd1Q14B62 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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ptchd1Q14B62 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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ptchd1Q14B62 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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ptchd1Q14B62 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ptchd1Q14B62 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ptchd1Q14B62 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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ptchd1Q14B62 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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ptchd1Q14B62 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ptchd1Q14B62 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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