Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rpusd3Q14AI6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rpusd3Q14AI6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rpusd3Q14AI6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rpusd3Q14AI6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rpusd3Q14AI6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rpusd3Q14AI6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rpusd3Q14AI6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rpusd3Q14AI6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rpusd3Q14AI6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rpusd3Q14AI6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rpusd3Q14AI6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd3Q14AI6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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