Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lingo4Q149C3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lingo4Q149C3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Lingo4Q149C3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Lingo4Q149C3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Lingo4Q149C3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Lingo4Q149C3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Lingo4Q149C3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Lingo4Q149C3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Lingo4Q149C3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lingo4Q149C3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Lingo4Q149C3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms