Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Traf3ip1Q149C2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Traf3ip1Q149C2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Traf3ip1Q149C2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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