Protein–RNA interactions for Protein: Q11136

Pepd, Xaa-Pro dipeptidase, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PepdQ11136 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PepdQ11136 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PepdQ11136 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms