Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc39dQ0VF76 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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