Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cntnap5bQ0V8T8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cntnap5bQ0V8T8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms