Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps8Q0P5W1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps8Q0P5W1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms