Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700061G19RikQ08EE8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms