Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc4Q08624 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms