Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kcnma1Q08460 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnma1Q08460 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms